Setelah melaksanakan vaksinasi tahap pertama pada tanggal 01 September 2021, siswa-siswi SMAN 1 Lamongan menjalani vaksinasi tahap kedua pada hari Jumat, 01 Oktober 2021 lalu. Kurang lebih ada 1500 siswa-siswi yang berantusias melakukan vaksinasi tahap kedua ini. Selain siswa-siswi SMAN 1 Lamongan, masyarakat sekitar dan beberapa pegawai yang bekerja di lingkungan SMAN 1 Lamongan juga berantusias untuk melaksanakan vaksinasi tahap kedua ini.
Seluruh peserta vaksinasi melakukan screening kondisi kesehatan sebelum melaksanakan vaksinasi. 
Setelah screening, seluruh peserta masuki ruang operator untuk penginputan data diri untuk melegalisasi proses vaksinasi kedua mereka.
Siswa-siswi melakukan pendataan sesuai dengan kelasnya masing-masing sebelum memasuki ruang vaksin.
Vaksinasi di lingkungan sekolah bertujuan untuk mendorong kesiapan pembelajaran tatap muka terbatas, selain itu vaksinasi secara keseluruhan sendiri mendorong masyarakat luas agar dapat mencapai herd community atau kekebalan komunitas di tengah pandemi Covid-19 ini. Dengan selesainya rangkaian vaksinasi di SMAN 1 Lamongan, diharapkan seluruh warga sekolah siap melaksanakan kegiatan belajar-mengajar secara tatap muka terbatas.
